En Konoha ha comenzado una nueva etapa marcada por la paz y la modernización. Los altos rascacielos se elevan en las calles, las pantallas gigantes exhiben una variedad de imágenes, y los sistemas de transporte interconectan los diversos distritos. Aunque sigue siendo una aldea de ninjas, la población civil ha crecido y la vida de los ninjas ha experimentado transformaciones. Boruto Uzumaki, hijo del Séptimo Hokage, Naruto Uzumaki, se ha matriculado en la Academia Ninja con el objetivo de adquirir conocimientos. Desde el principio, otros estudiantes lo desestiman y piensan que solo está allí por ser el "hijo del Hokage", pero pronto Boruto demostrará su valía y disipará todas esas dudas.