Hanyou no Yashahime narra la historia de las hijas de Sesshomaru e Inuyasha en una travesía que cruzará las barreras del tiempo. En el Japón feudal, las gemelas medio demonio Towa y Setsuna se ven separadas debido a un incendio forestal. Mientras Towa busca con desesperación a su hermana menor, descubre un enigmático túnel temporal que la transporta al Japón contemporáneo, donde conoce a Sora, el hermano de Kagome Higurashi, quien la acoge en su hogar. Diez años después, el túnel que conecta ambas épocas se reabre, permitiendo que Towa y Setsuna se reencuentren finalmente, aunque ahora Setsuna se ha convertido en cazadora de demonios al servicio de Kohaku. Para sorpresa de Towa, Setsuna parece haber olvidado completamente a su hermana mayor. Juntas a Moroha, la hija de Inuyasha y Kagome, las tres jóvenes emprenderán un viaje a través de las dos eras con la esperanza de recuperar los recuerdos perdidos de Setsuna.
